RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CDH9Q9ULB4 789 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 IFT52Q9Y366 437 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ISPDA4D126 451 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 H3BNX3 289 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ATG7O95352 703 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 S100A2P29034 98 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 STX4Q12846 297 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 KIF18BQ86Y91 864 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ERP44Q9BS26 406 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM9Q9C026 710 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.35□□□□□ -1.39
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