RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540900.7

NSRP1-206, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 2,057 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-206	ENST00000540900	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	NPW	Q8N729	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SOCS2	O14508	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	LGALS2	P05162	132 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TPH1	P17752	444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	FGFR3	P22607	806 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	GJA5	P36382	358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CD97	P48960	835 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PFKP	Q01813	784 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	POU4F1	Q01851	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PLOD2	O00469	737 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MYL3	P08590	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	NPR3	P17342	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	HMOX2	P30519	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MPP1	Q00013	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	RALGDS	Q12967	914 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	NME3	Q13232	169 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SPIDR	Q14159	915 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	DLGAP1	O14490	977 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	GPC4	O75487	556 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CNMD	O75829	334 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	LRPAP1	P30533	357 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	STT3A	P46977	705 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CD151	P48509	253 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ENTPD1	P49961	510 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	OMD	Q99983	421 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	MAGEB3	O15480	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TIPRL	O75663	272 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	PGK2	P07205	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	CKMT2	P17540	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	DCK	P27707	260 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	HUNK	P57058	714 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	TAS2R39	P59534	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	BNIP2	Q12982	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF460	Q14592	562 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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