RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IL11	P20809	199 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NNMT	P40261	264 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GSTM5	P46439	218 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RFX2	P48378	723 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GAS1	P54826	345 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UFM1	P61960	85 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GAD2	Q05329	585 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DMWD	Q09019	674 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PTP4A2	Q12974	167 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GAB1	Q13480	694 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAMK2D	Q13557	499 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ACVR2B	Q13705	512 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DCTN1	Q14203	1278 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CSHL1	Q14406	222 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PGM5	Q15124	567 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RTL10	Q7L3V2	364 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRABD2A	Q86V40	505 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FSIP1	Q8NA03	581 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ELP5	Q8TE02	316 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	VPS33A	Q96AX1	596 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FNBP1	Q96RU3	617 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYNC	Q9H7C4	482 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SARDH	Q9UL12	918 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BAG5	Q9UL15	447 aa		3	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A6NNC1	897 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GRM8	O00222	908 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSPAN4	O14817	238 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MDM4	O15151	490 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LDLRAD4	O15165	306 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC7A4	O43246	635 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TNFSF14	O43557	240 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM63A	O94886	807 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHRNB1	P11230	501 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SELL	P14151	372 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TM4SF1	P30408	202 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC5A2	P31639	672 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CIITA	P33076	1130 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ABCD1	P33897	745 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP6V1E1	P36543	226 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	STAT6	P42226	847 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AGTR2	P50052	363 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLIN5	Q00G26	463 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RUNX2	Q13950	521 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CBFB	Q13951	182 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAMK1	Q14012	370 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NFE2L1	Q14494	772 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MMEL1	Q495T6	779 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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