RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519224.5

HSF4-208, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 5

Gene HSF4, Length 637 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-208	ENST00000519224	MMP20	O60882	483 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	CCNB1	P14635	433 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	MX2	P20592	715 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	AP1S1	P61966	158 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	ITK	Q08881	620 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	AP1B1	Q10567	949 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	TFDP2	Q14188	446 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-208	ENST00000519224	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224		A8MX80	341 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224		H0Y8X5	98 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	NEMP1	O14524	444 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	PDHA1	P08559	390 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SERPINA4	P29622	427 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RWDD2B	P57060	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CLDN2	P57739	230 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	PDK1	Q15118	436 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	UGP2	Q16851	508 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224		A0A0U1RQS6	177 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SLC30A4	O14863	429 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	TSPAN6	O43657	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	KRT86	O43790	486 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	MMP2	P08253	660 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CCDC175	P0C221	793 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	TGM2	P21980	687 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CD38	P28907	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CTSK	P43235	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ID4	P47928	161 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	GRIA4	P48058	902 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	GRM3	Q14832	879 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	FATE1	Q969F0	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-208	ENST00000519224	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms