RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	TIMP2	P16035	220 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	MMP12	P39900	470 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	TAS2R40	P59535	323 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	SGCG	Q13326	291 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF235	Q14590	738 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	PDK2	Q15119	407 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	UGP2	Q16851	508 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	BMF	Q96LC9	184 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM28-208	ENST00000495327	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	POM121B	A6NF01	834 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	TOR1B	O14657	336 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MFSD11	O43934	449 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SOCS5	O75159	536 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CR2	P20023	1033 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SPINK2	P20155	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	GJC1	P36383	396 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PFN3	P60673	137 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	BNIP3	Q12983	259 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	AGER	Q15109	404 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327		Q6ZSR6	202 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	GATA6	Q92908	595 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	IGF2R	P11717	2491 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PQ67	120 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ENC1	O14682	589 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MMP20	O60882	483 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ITIH2	P19823	946 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	IGFALS	P35858	605 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SCNN1B	P51168	640 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	GALNT2	Q10471	571 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MESD	Q14696	234 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PARG	Q86W56	976 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	FATE1	Q969F0	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	SDC3	O75056	442 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	PIAS2	O75928	621 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	LCA5L	O95447	670 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	CSF2	P04141	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	C6	P13671	934 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM28-208	ENST00000495327	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26

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