RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493583.5

TFE3-204, Transcript of transcription factor binding to IGHM enhancer 3, human

TSL 2

Gene TFE3, Length 3,279 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFE3-204	ENST00000493583	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583		A0A0U1RQS6	177 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MDM4	O15151	490 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	H6PD	O95479	791 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MAG	P20916	626 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	GGT5	P36269	586 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	SDHD	O14521	159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	UBD	O15205	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MCF2	P10911	925 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PROZ	P22891	400 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	KCNC1	P48547	511 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TKTL1	P51854	596 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	DDHD2	O94830	711 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ELK4	P28324	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	IST1	P53990	364 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583		A0A1B0GTL3	188 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	CLCN2	P51788	898 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	FOXA1	P55317	472 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	DMPK	Q09013	629 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ITCH	Q96J02	903 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	DRC3	Q9H069	523 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	HUS1	O60921	280 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	RECQL4	O94761	1208 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MYL3	P08590	195 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	SLC1A2	P43004	574 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	CCL14	Q16627	93 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	EI24	O14681	340 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	LINC00032	P0C843	101 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	HOXD12	P35452	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TFE3-204	ENST00000493583	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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