RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 BCAT1P54687 386 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RAB41Q5JT25 222 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PMF1Q6P1K2 205 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 USP30Q70CQ3 517 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 H2AFVQ71UI9 128 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GAREM2Q75VX8 874 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 KIAA1328Q86T90 577 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ITIH5Q86UX2 942 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RASSF3Q86WH2 238 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NUP93Q8N1F7 819 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ELMOD1Q8N336 334 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CFHR4Q92496 578 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MYADMQ96S97 322 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 LHX5Q9H2C1 402 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ASAH2Q9NR71 780 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 HESX1Q9UBX0 185 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 C5orf42Q9H799 3197 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PLXNA3P51805 1871 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ANKRD62A6NC57 917 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MATN2O00339 956 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GPR42O15529 346 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 OPHN1O60890 802 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CELA3BP08861 270 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 YWHAQP27348 245 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GABRR2P28476 465 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NOMO3P69849 1222 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GPC5P78333 572 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 HGFACQ04756 655 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PLP2Q04941 152 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 KIF5AQ12840 1032 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TAF10Q12962 218 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PTP4A2Q12974 167 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 STAT4Q14765 748 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TEAD2Q15562 447 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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TPR-208ENST00000492973 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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TPR-208ENST00000492973 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ING5Q8WYH8 240 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 HSFY1Q96LI6 401 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ASB2Q96Q27 587 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 LMF1Q96S06 567 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NMUR1Q9HB89 426 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 COMMD8Q9NX08 183 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 NR2E1Q9Y466 385 aa7.13□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.13□□□□□ -1.27
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TPR-208ENST00000492973 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ZNF197O14709 1029 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 KRT86O43790 486 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPR-208ENST00000492973 DNAJC6O75061 913 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 ULK1O75385 1050 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 FGF19O95750 216 aa7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TUBB4AP04350 444 aa7.12□□□□□ -1.27
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