RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, human

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RERE-215	ENST00000492766	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	IHH	Q14623	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CSRP2	Q16527	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766		A0A1W2PPC4	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766		A0A1W2PQU0	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PCDH8	O95206	1070 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PRKCG	P05129	697 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ITIH2	P19823	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CD27	P26842	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	MMP12	P39900	470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ITK	Q08881	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	XRCC4	Q13426	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CARD9	Q9H257	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766		H7C0C1	242 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	KCNK3	O14649	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PGLS	O95336	258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CP	P00450	1065 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CFI	P05156	583 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	MMP2	P08253	660 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PRLR	P16471	622 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ATP5O	P48047	213 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	LMNB2	Q03252	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	FGL2	Q14314	439 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	UGP2	Q16851	508 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RERE-215	ENST00000492766		A0A1B0GTW7	788 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	NEMP1	O14524	444 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	WNT9A	O14904	365 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	MTSS1	O43312	755 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	TSPAN6	O43657	245 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	SERPINF2	P08697	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	RBP3	P10745	1247 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	RBL1	P28749	1068 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	CD86	P42081	329 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	SUOX	P51687	545 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	SKOR1	P84550	965 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	SEMG2	Q02383	582 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	RALGDS	Q12967	914 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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