RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490417.6

SFXN4-208, Transcript of sideroflexin 4, human

TSL 2

Gene SFXN4, Length 952 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFXN4-208	ENST00000490417	KRT10	P13645	584 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	MX2	P20592	715 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	IL1R2	P27930	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	RABIF	P47224	123 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	AP1S1	P61966	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CYTH1	Q15438	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PDF	Q9HBH1	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KCNK3	O14649	394 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	WNT1	P04628	370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ALPPL2	P10696	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PRLR	P16471	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	AMPD1	P23109	780 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	GK	P32189	559 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC1A1	P43005	524 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SCNN1B	P51168	640 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	MMP16	P51512	607 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SPA17	Q15506	151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SRL	Q86TD4	932 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	IGLON5	A6NGN9	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417		H3BM21	787 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CES1	P23141	567 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	UGP2	Q16851	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417		Q6ZSR6	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KLK6	Q92876	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	AREL1	O15033	823 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	C1S	P09871	688 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TIMP2	P16035	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	CA4	P22748	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	GJC1	P36383	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	THOP1	P52888	689 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	YPEL5	P62699	121 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	IL9R	Q01113	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	MESD	Q14696	234 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	NPW	Q8N729	165 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SFXN4-208	ENST00000490417	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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