RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 DEC1Q9P2X7 70 aa17.15■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 LRCH4O75427 683 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 ELFN1P0C7U0 828 aa17.15■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 DET1Q7L5Y6 550 aa17.15■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 RNF145Q96MT1 663 aa17.14■□□□□ 0.33
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NISCH-213ENST00000489895 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
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NISCH-213ENST00000489895 KLHL5Q96PQ7 755 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 BRD9Q9H8M2 597 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PTPRHQ9HD43 1115 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PIGRP01833 764 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.338e-10■□□□□ 9.9
NISCH-213ENST00000489895 CERS6Q6ZMG9 384 aa17.12■□□□□ 0.33
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