RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483421.7

ZNF638-217, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 2,076 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-217	ENST00000483421	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SPTLC2	O15270	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ASAP2	O43150	1006 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	TIPRL	O75663	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CER1	O95813	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	INHBB	P09529	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	HGF	P14210	728 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ITGAL	P20701	1170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CDC25A	P30304	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CD52	P31358	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	UQCRC1	P31930	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ARL2	P36404	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GATM	P50440	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GPC3	P51654	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	7e-13	■□□□□ 9.4
ZNF638-217	ENST00000483421	FZD5	Q13467	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	PKP1	Q13835	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	E2F2	Q14209	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	EMC2	Q15006	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MYH11	P35749	1972 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MFAP3L	O75121	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CYP11B2	P19099	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CR2	P20023	1033 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GLDC	P23378	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	EPHA3	P29320	983 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	HOXD13	P35453	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	PGM1	P36871	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	FAM189B	P81408	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	DEFB103A	P81534	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GALNT2	Q10471	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	4e-6	■□□□□ 8.6
ZNF638-217	ENST00000483421	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	REV3L	O60673	3130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421		E9PMD0	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	SUN1	O94901	812 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	GJB5	O95377	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	YEATS4	O95619	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	HTR7	P34969	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-217	ENST00000483421	UBA7	P41226	1012 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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