RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DPYSQ14117 519 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 APBB2Q92870 758 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GJD2Q9UKL4 321 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MRASO14807 208 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1DO94832 1006 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ATICP31939 592 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN7P35236 360 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CARM1Q86X55 608 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HM13Q8TCT9 377 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HTRA1Q92743 480 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 EXT2Q93063 718 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NRBF2Q96F24 287 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 UBP1Q9NZI7 540 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 INPP4BO15327 924 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2C9P11712 490 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 BEX3Q00994 111 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC39Q96DD0 335 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SNX27Q96L92 541 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF597Q96LX8 424 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WDR70Q9NW82 654 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PTGES3LE9PB15 166 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 BAIAP3O94812 1187 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ8Q15842 424 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FUT11Q495W5 492 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IGFN1Q86VF2 1251 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TCF12Q99081 682 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.34■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C1QAP02745 245 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LRPAP1P30533 357 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFV1P49821 464 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RHDQ02161 417 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF460Q14592 562 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA2Q15349 733 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MOGQ16653 247 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC153Q494R4 210 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 URGCPQ8TCY9 931 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ACMSDQ8TDX5 336 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 STARD8Q92502 1023 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf50Q9BV19 199 aa16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 EI24O14681 340 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 S100A1P23297 94 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NUMBP49757 651 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TUBA4AP68366 448 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CCNA1P78396 465 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 STX5Q13190 355 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PPTC7Q8NI37 304 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TBCBQ99426 244 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MED10Q9BTT4 135 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TGM2P21980 687 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MERTKQ12866 999 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BOLA3Q53S33 107 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BEST2Q8NFU1 509 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CERS2Q96G23 380 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP42Q96MM3 310 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.33■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BMP10O95393 424 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PSMB4P28070 264 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ACADVLP49748 655 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PIGFQ07326 219 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NFATC3Q12968 1075 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IMPG1Q17R60 797 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms