RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NOXA1Q86UR1 476 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ERGIC1Q969X5 290 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 LRP12Q9Y561 859 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 A0A0U1RQF3 1178 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 GAGE10A6NGK3 116 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 VNN2O95498 520 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CAMK1Q14012 370 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 AADATQ8N5Z0 425 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 FAM216AQ8WUB2 273 aa7□□□□□ -1.29
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SGCE-210ENST00000472326 KIF1BPQ96EK5 621 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 RNF125Q96EQ8 232 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 GJD2Q9UKL4 321 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 KLK8O60259 260 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 PCNAP12004 261 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 FCGR1AP12314 374 aa6.99□□□□□ -1.29
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SGCE-210ENST00000472326 KEAP1Q14145 624 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ASIC2Q16515 512 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 HLFQ16534 295 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 MEIS3Q99687 375 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SELENONQ9NZV5 590 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CH25HO95992 272 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 AGR2O95994 175 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NFATC4Q14934 902 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TDRPQ86YL5 185 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ST8SIA4Q92187 359 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 KLHL15Q96M94 604 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 BBS4Q96RK4 519 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 FIZ1Q96SL8 496 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TSPAN4O14817 238 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NPHP1O15259 732 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 HEXAP06865 529 aa6.97□□□□□ -1.29
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SGCE-210ENST00000472326 ITGAXP20702 1163 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ABCD3P28288 659 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 DDR1Q08345 913 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TRAF2Q12933 501 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ITGADQ13349 1161 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 BAK1Q16611 211 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NAA35Q5VZE5 725 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 RRM2BQ7LG56 351 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SHFQ7M4L6 423 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 LMO3Q8TAP4 145 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SNAPC3Q92966 411 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CD93Q9NPY3 652 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 PROCRQ9UNN8 238 aa6.97□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PAFAH1B1P43034 410 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PPP2R5BQ15173 497 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 OTULINQ96BN8 352 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 VEZTQ9HBM0 779 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.96□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.96□□□□□ -1.3
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