RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CDC6	Q99741	560 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NT5M	Q9NPB1	228 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DKK3	Q9UBP4	350 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880		A8MX80	341 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MUSK	O15146	869 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RAD51B	O15315	384 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	YKT6	O15498	198 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MAFK	O60675	156 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP25	P42331	645 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FGL2	Q14314	439 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	UGP2	Q16851	508 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HS1BP3	Q53T59	392 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RFX6	Q8HWS3	928 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RAPGEF5	Q92565	580 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF670	Q9BS34	389 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TFR2	Q9UP52	801 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	WASF3	Q9UPY6	502 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	POM121B	A6NF01	834 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FFAR2	O15552	330 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SPINT1	O43278	529 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGA12	O60330	932 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KDELR1	P24390	212 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IL4R	P24394	825 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	THOP1	P52888	689 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	AP1S1	P61966	158 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DYNLT1	P63172	113 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SPC24	Q8NBT2	197 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PSKH2	Q96QS6	385 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	INTU	Q9ULD6	942 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	AREL1	O15033	823 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CP	P00450	1065 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	COMT	P21964	271 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RABIF	P47224	123 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK1D	P48730	415 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LIG3	P49916	1009 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SUOX	P51687	545 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ARSE	P51690	589 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GBE1	Q04446	702 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SHB	Q15464	509 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DENND2C	Q68D51	928 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SAP25	Q8TEE9	199 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	BMF	Q96LC9	184 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NOD2	Q9HC29	1040 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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