RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ACOT9Q9Y305 439 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EI24O14681 340 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CLOCKO15516 846 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 VTNP04004 478 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 BMP2P12643 396 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GALNT2Q10471 571 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 POU6F1Q14863 301 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 RETREG3Q86VR2 466 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NIM1KQ8IY84 436 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NPWQ8N729 165 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NAT16Q8N8M0 369 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 RDH11Q8TC12 318 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOJQ9H4E5 214 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 PALMDQ9NP74 551 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SETD4Q9NVD3 440 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX10Q9Y5X0 201 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EVPLQ92817 2033 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NR5A2O00482 541 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 AURKAO14965 403 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NRP2O60462 931 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SULT1C4O75897 302 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NR4A1P22736 598 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MYF6P23409 242 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CSRP3P50461 194 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CXCL9Q07325 125 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGADQ13349 1161 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CSHL1Q14406 222 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NIPAL1Q6NVV3 410 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ELMO2Q96JJ3 720 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR78Q96P69 363 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TMED5Q9Y3A6 229 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP205Q92621 2012 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKBIEO00221 500 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NME4O00746 187 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF24P17028 368 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MATN1P21941 496 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 LMO2P25791 158 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MLLT10P55197 1068 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 LAMC2Q13753 1193 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SQLEQ14534 574 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 IFNEQ86WN2 208 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM17Q9Y577 477 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 DHRS12A0PJE2 317 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 M0QYT0 321 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ERCC2P18074 760 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2B6P20813 491 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CDH3P22223 829 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TTKP33981 857 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKAA2P54646 552 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R39P59534 338 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ADIGQ0VDE8 80 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MOGQ16653 247 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 METTL7BQ6UX53 244 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SULF1Q8IWU6 871 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GNPTGQ9UJJ9 305 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 LCTP09848 1927 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 STMN1P16949 149 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFV1P49821 464 aa13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms