RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 GAGE1Q13065 139 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GAGE4Q13068 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 POSTNQ15063 836 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CES5AQ6NT32 575 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 WBP1Q96G27 269 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 FEM1CQ96JP0 617 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 C3orf30Q96M34 536 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 UHRF2Q96PU4 802 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 EBF2Q9HAK2 575 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 NOX4Q9NPH5 578 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CHRM4P08173 479 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 LINC00271P0C7V0 271 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SRD5A1P18405 259 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CHKAP35790 457 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF132P52740 706 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP10-5P60370 271 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ACTR2P61160 394 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TROAPQ12815 778 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZBTB17Q13105 803 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TNFAIP1Q13829 316 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PRKG1Q13976 671 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MORC3Q14149 939 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ERGIC1Q969X5 290 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MMP28Q9H239 520 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SLC32A1Q9H598 525 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SIX4Q9UIU6 781 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.55□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CBY3A6NI87 242 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HSPB2A8KAH6 182 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 B9A039 149 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ANP32CO43423 234 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CEP104O60308 925 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZIC3O60481 467 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KCNA5P22460 613 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RYKP34925 604 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ECT2LQ008S8 904 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RUNX2Q13950 521 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ARHGEF6Q15052 776 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HSPB2Q16082 182 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ESCO2Q56NI9 601 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PMS2CLQ68D20 193 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MYCT1Q8N699 235 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 OTULINQ96BN8 352 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 FEM1BQ9UK73 627 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SUFUQ9UMX1 484 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GDAQ9Y2T3 454 aa3.54□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 A0A0G2JPF8 293 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 WNT9BO14905 357 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PER2O15055 1255 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CRYAAP02489 173 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 WEE2P0C1S8 567 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GLIPR1P48060 266 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RHBDL3P58872 404 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PHEXP78562 749 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 EFNB3Q15768 340 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms