RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C11orf70Q9BRQ4 267 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EDEM3Q9BZQ6 932 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM117AQ9C073 453 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STRADBQ9C0K7 418 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KLC2Q9H0B6 622 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NDST4Q9H3R1 872 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRN3Q9H3W5 708 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KIAA1468Q9P260 1216 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF212Q9UDV6 495 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KLQ9UEF7 1012 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PISDQ9UG56 409 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RWDD2AQ9UIY3 292 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RABGEF1Q9UJ41 708 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM59LQ9UK28 342 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PADI4Q9UM07 663 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HPCAL4Q9UM19 191 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR34Q9UPC5 381 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LOXL2Q9Y4K0 774 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OR1A2Q9Y585 309 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 COL12A1Q99715 3063 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HECTD1Q9ULT8 2610 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 A0A1W2PQM1 296 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GOLGA6CA6NDK9 693 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GOLGA6BA6NDN3 693 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C2CD4BA6NLJ0 364 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 A8MX80 341 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 B4DGG1 531 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RASA4BC9J798 803 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 D6RAR5 112 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 F8VZ95 297 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PLD2O14939 933 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 AREL1O15033 823 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TEX33O43247 280 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RASA4O43374 803 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KDELR3O43731 214 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CREB3O43889 395 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NOBOXO60393 691 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PRAMEF10O60809 474 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ITGA2BP08514 1039 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ALPIP09923 528 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM87AP0C7U9 286 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GOLGA6DP0CG33 693 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LIPCP11150 499 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CHRNB2P17787 502 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 WT1P19544 449 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ITIH1P19827 911 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GPD1P21695 349 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HTR1BP28222 390 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ADRA1BP35368 520 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SCNN1AP37088 669 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ETFBP38117 255 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ETV5P41161 510 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KLK7P49862 253 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LIG3P49916 1009 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HK3P52790 923 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HDAC4P56524 1084 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RHOAP61586 193 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CYP4F2P78329 520 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FMO1Q01740 532 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ELP6Q0PNE2 266 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGEF7Q14155 803 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 INPP5AQ14642 412 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NFATC4Q14934 902 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRC14Q15048 493 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CYTH1Q15438 398 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LINC00303Q3SY05 128 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 AMZ1Q400G9 498 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MAP9Q49MG5 647 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM52BQ4KMG9 183 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EFHC2Q5JST6 749 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms