RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 GFPT2O94808 682 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 TIMP2P16035 220 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 HK3P52790 923 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 CLN3Q13286 438 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 IRF4Q15306 451 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM52BQ4KMG9 183 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM72Q6ZMU5 477 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 MED8Q96G25 268 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 KRT3P12035 628 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 ITIH2P19823 946 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 GSCP56915 257 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC14Q15048 493 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 SLC30A5Q8TAD4 765 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 HCAR2Q8TDS4 363 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 GANQ9H2C0 597 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 GULP1Q9UBP9 304 aa26.64■■□□□ 1.86
PBRM1-218ENST00000458294 RASGRP1O95267 797 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GJB6O95452 261 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CTSEP14091 401 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CHRNB2P17787 502 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 HTR1BP28222 390 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 EPHB2P29323 1055 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SLFN11Q7Z7L1 901 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 KYQ8NBH2 561 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PCDH19Q8TAB3 1148 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 LRP4O75096 1905 aa26.63■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 LRRK1Q38SD2 2015 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PLD2O14939 933 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GPD1P21695 349 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PTP4A2Q12974 167 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GRM3Q14832 879 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 NFATC4Q14934 902 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ALG11Q2TAA5 492 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 WSCD2Q2TBF2 565 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PARP15Q460N3 678 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GKN2Q86XP6 184 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 HID1Q8IV36 788 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR6C4Q8NGE1 309 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ATL2Q8NHH9 583 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC74AQ96AQ1 378 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 NCAPGQ9BPX3 1015 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.62■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 UNGP13051 313 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SOX5P35711 763 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SERINC3Q13530 473 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 AGERQ15109 404 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 EFHC2Q5JST6 749 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ENPP7Q6UWV6 458 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 DNAAF5Q86Y56 855 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO39Q8N4B4 442 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 COL26A1Q96A83 441 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 HMCESQ96FZ2 354 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 STRADBQ9C0K7 418 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 KLC2Q9H0B6 622 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 EPB41L5Q9HCM4 733 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 LHX3Q9UBR4 397 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RABGEF1Q9UJ41 708 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 COQ6Q9Y2Z9 468 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.61■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 TSPAN11A1L157 253 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 WASH4PA8MWX3 477 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RASA4BC9J798 803 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 D6RAR5 112 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 INSIG1O15503 277 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RASA4O43374 803 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 NSFP46459 744 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 JAM2P57087 298 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 UGP2Q16851 508 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RAB11FIP2Q7L804 512 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PYROXD2Q8N2H3 581 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 NETO2Q8NC67 525 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 C3orf20Q8ND61 904 aa26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms