RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	OR1A2	Q9Y585	309 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SDK2	Q58EX2	2172 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CDC14C	A4D256	554 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KRIT1	O00522	736 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TOR1B	O14657	336 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ZW10	O43264	779 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	STK17B	O94768	372 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	UGT2B4	P06133	528 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FURIN	P09958	794 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	F8A1	P23610	371 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NR2F2	P24468	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CD1C	P29017	333 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CCR1	P32246	355 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MXI1	P50539	228 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PEX5	P50542	639 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CDH4	P55283	916 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ABHD18	Q0P651	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CUL2	Q13617	745 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	INPP5A	Q14642	412 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NFATC4	Q14934	902 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC39A14	Q15043	492 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC14	Q15048	493 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	STK38	Q15208	465 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ALF	Q53S48	1182 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM135	Q86UB9	458 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	OR7D4	Q8NG98	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ATL2	Q8NHH9	583 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RTP4	Q96DX8	246 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PDXP	Q96GD0	296 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	WDR92	Q96MX6	357 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25	2e-6	■□□□□ 9.1
HDLBP-222	ENST00000449504	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	DDIT4	Q9NX09	232 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	POLH	Q9Y253	713 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	LRBA	P50851	2863 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MED13	Q9UHV7	2174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A1B0GTL3	188 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504		A6NCN8	305 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504		B4E171	279 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MAPK13	O15264	365 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	INPP4B	O15327	924 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KRT86	O43790	486 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PAGE1	O75459	146 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PCCB	P05166	539 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC2A3	P11169	496 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	DLST	P36957	453 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPAN7	P41732	249 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PGD	P52209	483 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB15	P59190	212 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CDK17	Q00537	523 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NME3	Q13232	169 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NR6A1	Q15406	480 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TAF5	Q15542	800 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CNGA2	Q16280	664 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM270	Q6UE05	265 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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