RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445609.6

NPHP1-207, Transcript of nephrocystin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP1, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1-207ENST00000445609 NAT9Q9BTE0 207 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ANTXRLA6NF34 631 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 FZD6O60353 706 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PGLSO95336 258 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 EGFP01133 1207 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ALADP13716 330 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 HLA-EP13747 358 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SEC13P55735 322 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CRADDP78560 199 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ENPP2Q13822 863 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 GALNT3Q14435 633 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CASP8Q14790 479 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 DENND2CQ68D51 928 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CCNJLQ8IV13 435 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CHPFQ8IZ52 775 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PAF1Q8N7H5 531 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 FAM3CQ92520 227 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 VOPP1Q96AW1 172 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SYBUQ9NX95 663 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.6□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 MAN2B1O00754 1011 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 RIPK2O43353 540 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ACSL3O95573 720 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 EPHX1P07099 455 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PRKCHP24723 683 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 TIE1P35590 1138 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 EPHB1P54762 984 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 POU6F1Q14863 301 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ARSIQ5FYB1 569 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PCID2Q5JVF3 399 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ARMC3Q5W041 872 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 IL36AQ9UHA7 158 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 A0A1W2PQ67 120 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SHISA7A6NL88 538 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SIN3BO75182 1162 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 LEFTY1O75610 366 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 UGT2B4P06133 528 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 TSHRP16473 764 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ADRA1DP25100 572 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SLC29A2Q14542 456 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 FBXO43Q4G163 708 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 C2orf27AQ580R0 203 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 CFAP58Q5T655 872 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 SDE2Q6IQ49 451 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 STK40Q8N2I9 435 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 FUT8Q9BYC5 575 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.59□□□□□ -0.87
NPHP1-207ENST00000445609 PRNPP04156 253 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 POLBP06746 335 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 CTSLP07711 333 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 BMP1P13497 986 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 PGAM1P18669 254 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 NTSR1P30989 418 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 SLC8A1P32418 973 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 WASP42768 502 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 GRIA4P48058 902 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 GPX6P59796 221 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 QPCTQ16769 361 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.58□□□□□ -0.88
NPHP1-207ENST00000445609 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms