RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC153Q494R4 210 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF34Q969K3 372 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDH19Q9H159 772 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM216Q9P0N5 145 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MSI1O43347 362 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC166P0CW27 439 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAF10Q12962 218 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PEX6Q13608 980 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOFQ13790 326 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C16orf89Q6UX73 402 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UNC5BQ8IZJ1 945 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF461Q8TAF7 563 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COG4Q9H9E3 785 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCAP29Q9UHQ4 241 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INSL6Q9Y581 213 aa17.4■□□□□ 0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGAP10A1A4S6 786 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM72CH0Y354 149 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABLIM3O94929 683 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP3K6O95382 1288 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEC24AO95486 1093 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00271P0C7V0 271 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THRAP10827 490 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CPA3P15088 417 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSPA13P48723 471 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NR2C2P49116 596 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TUFMP49411 452 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADRM1Q16186 407 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM72BQ86X60 149 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZFP28Q8NHY6 868 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ISL2Q96A47 359 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CNDP1Q96KN2 507 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRGUKQ96M69 825 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RIMS3Q9UJD0 308 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AP4B1Q9Y6B7 739 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM114B3SHH9 223 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZMPSTE24O75844 475 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FGF18O76093 207 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGEA12P43365 314 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYBPC1Q00872 1141 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GBE1Q04446 702 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYLK3Q32MK0 819 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TPGS2Q68CL5 300 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRRC8BQ6P9F7 803 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CATSPER2Q96P56 530 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COMMD8Q9NX08 183 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.39■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRGAP2BP0DMP2 458 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PGAM1P18669 254 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEMA3BQ13214 749 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HERC6Q8IVU3 1022 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NAT9Q9BTE0 207 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC22A2O15244 555 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IMPDH2P12268 514 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DPYSQ14117 519 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MSANTD2Q6P1R3 559 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRRN4Q8WUT4 740 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARNTL2Q8WYA1 636 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HERVK_113Q902F9 699 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SERPINB11Q96P15 392 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THEGQ9P2T0 379 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNX10Q9Y5X0 201 aa17.38■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TYK2P29597 1187 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCR1P32246 355 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GARSP41250 739 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NR1H2P55055 460 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TPI1P60174 286 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAB33AQ14088 237 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PIGGQ5H8A4 983 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPM1JQ5JR12 505 aa17.37■□□□□ 0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BRMS1LQ5PSV4 323 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms