RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRELD1Q96HD1 420 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 APOLD1Q96LR9 279 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYT11Q9BT88 431 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 USP29Q9HBJ7 922 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANO10Q9NW15 660 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLF15Q9UIH9 416 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AK5Q9Y6K8 562 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.54□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WASH4PA8MWX3 477 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BM21 787 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NEMP1O14524 444 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FPGTO14772 594 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BUB1O43683 1085 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OPA1O60313 960 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BRINP1O60477 761 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NEBLO76041 1014 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MT-CO3P00414 261 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABCG1P45844 678 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AIF1P55008 147 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBXN1Q04323 297 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SERINC3Q13530 473 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACAP1Q15027 740 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STX1AQ16623 288 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PARP15Q460N3 678 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EFHC2Q5JST6 749 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMC6Q7Z403 805 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MEIOBQ8N635 442 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CENPTQ96BT3 561 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HMCESQ96FZ2 354 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MCEEQ96PE7 176 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AGPAT1Q99943 283 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNPY3Q9BT09 278 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLC2Q9H0B6 622 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DKK3Q9UBP4 350 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FZD10Q9ULW2 581 aa9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANKRD62A6NC57 917 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RASA4BC9J798 803 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TPP1O14773 563 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AQP9O43315 295 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RASA4O43374 803 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WFS1O76024 890 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGSF6O95976 241 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYF5P13349 255 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITPKBP27987 946 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HTR7P34969 479 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGFALSP35858 605 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOAP61586 193 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OGDHQ02218 1023 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NETO2Q8NC67 525 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FGF11Q92914 225 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBATAQ96M53 351 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GBP4Q96PP9 640 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC19Q9H756 370 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDFQ9HBH1 243 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LHX3Q9UBR4 397 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.52□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TSPAN11A1L157 253 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TOR1BO14657 336 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CREB3O43889 395 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MMP20O60882 483 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC172P0C7W6 258 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BMP2P12643 396 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP1A3P13637 1013 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FERP16591 822 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SUOXP51687 545 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms