RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 UGP2Q16851 508 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC38Q5VT99 294 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 GATAD2AQ86YP4 633 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 NAXDQ8IW45 347 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 OR13H1Q8NG92 308 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 MAML1Q92585 1016 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 KRT35Q92764 455 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 DESI2Q9BSY9 194 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 NT5MQ9NPB1 228 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 GPR27Q9NS67 375 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 NEMP1O14524 444 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 SPOPO43791 374 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DQB2P05538 268 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 THEGLP0DJG4 465 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 KRT10P13645 584 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 GM2AP17900 193 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 AKT2P31751 481 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 NUDT1P36639 197 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 CDKN2BP42772 138 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 TRAF2Q12933 501 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF235Q14590 738 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 MARC1Q5VT66 337 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZSR6 202 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 IQCHQ86VS3 1027 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HCAR2Q8TDS4 363 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 SAP25Q8TEE9 199 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 CENPTQ96BT3 561 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 KLHDC7BQ96G42 594 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 TSGA13Q96PP4 275 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM14Q96QK8 99 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 LGMNQ99538 433 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 GDF3Q9NR23 364 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa10.83□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0U1RQS6 177 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 A8MX80 341 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF487B1APH4 448 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 APOL1O14791 398 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 MATN3O15232 486 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PJA2O43164 708 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PSTPIP1O43586 416 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHGA12O60330 932 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 C6P13671 934 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 CCNCP24863 283 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 PMLP29590 882 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 SERPINA4P29622 427 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 IGFALSP35858 605 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 MMP12P39900 470 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 RXRGP48443 463 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 LIG3P49916 1009 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 CCT8P50990 548 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 RENBPP51606 427 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 VAV2P52735 878 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 AP1S1P61966 158 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 DYNLT1P63172 113 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 DSC2Q02487 901 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 BCL2L1Q07817 233 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB17Q13105 803 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 GRM3Q14832 879 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 VSIG1Q86XK7 387 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 RFX6Q8HWS3 928 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 CXorf40AQ8TE69 158 aa10.82□□□□□ -0.68
ATG4B-210ENST00000428861 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms