RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CBX6O95503 412 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 HADHAP40939 763 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CSRP3P50461 194 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB16Q05516 673 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 TMC7Q7Z402 723 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM237Q96Q45 408 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 OBSL1O75147 1896 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 G3V2L1 256 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 CXCL14O95715 111 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 RALBP11234 206 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 AQP5P55064 265 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R39P59534 338 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM14Q96QK8 99 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ACSS2Q9NR19 701 aa23.37■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 FGF1P05230 155 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 RAB10P61026 200 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 DBN1Q16643 649 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TTC7BQ86TV6 843 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 MOCOSQ96EN8 888 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TBATAQ96M53 351 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 INSIG1O15503 277 aa23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF9O75901 435 aa23.35■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 LRG1P02750 347 aa23.35■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A1Q13621 1099 aa23.35■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 TRIB3Q96RU7 358 aa23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.35■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 OLFM2O95897 454 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A1P02730 911 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 T-ENOLP0DO92 83 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SKA1Q96BD8 255 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 RMDN1Q96DB5 314 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SCYL1Q96KG9 808 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 OMDQ99983 421 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT9Q9Y305 439 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PRU2 124 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CD160O95971 181 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CILP2Q8IUL8 1156 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 BADQ92934 168 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SORT1Q99523 831 aa23.34■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 PLK2Q9NYY3 685 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 VPS28Q9UK41 221 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 LCHNA4D1U4 455 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 NDST3O95803 873 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 EPOP01588 193 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 FGBP02675 491 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 PDHA1P08559 390 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CR2P20023 1033 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ERVFC1P60507 584 aa23.33■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 DLG1Q12959 904 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TMC8Q8IU68 726 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CALML6Q8TD86 181 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 NXNL1Q96CM4 212 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 OLFM1Q99784 485 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TCF25Q9BQ70 676 aa23.33■■□□□ 1.33
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