RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 MMP12P39900 470 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ACADVLP49748 655 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CDH6P55285 790 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PFN3P60673 137 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SEMG2Q02383 582 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SRLQ86TD4 932 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PGBD5Q8N414 524 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LZTR1Q8N653 840 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LRP4O75096 1905 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZZEF1O43149 2961 aa15.62■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 MFSD11O43934 449 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CR2P20023 1033 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 GJC1P36383 396 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RALGDSQ12967 914 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 DPYSL3Q14195 570 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 UGP2Q16851 508 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PROX2Q3B8N5 592 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 DHRS13Q6UX07 377 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PSKH2Q96QS6 385 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.61■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 FPGTO14772 594 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SIGLEC6O43699 453 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TM7SF2O76062 418 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 H2AFZP0C0S5 128 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TMEM253P0C7T8 217 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 C6P13671 934 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 GM2AP17900 193 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RABIFP47224 123 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SGCGQ13326 291 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 GRM3Q14832 879 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 IRF4Q15306 451 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CCDC157Q569K6 752 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 H2AFVQ71UI9 128 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 IFT43Q96FT9 208 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF599Q96NL3 588 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SEPT3Q9UH03 358 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 U3KQA8 63 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 LAMA5O15230 3695 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 KNTC1P50748 2209 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 APC2O95996 2303 aa15.6■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 FAM149AA5PLN7 773 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CSF2P04141 144 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SCNN1BP51168 640 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ELP6Q0PNE2 266 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 CAMK2BQ13554 666 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 KRT81Q14533 505 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 SARM1Q6SZW1 724 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 PARGQ86W56 976 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 RBFAQ8N0V3 343 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 OR4C6Q8NH72 309 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 FAF2Q96CS3 445 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 MGME1Q9BQP7 344 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.59■□□□□ 0.09
SPC24-201ENST00000423327 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms