RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 LY86O95711 162 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FGF19O95750 216 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OR4Q2P0C623 313 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 AVPR1AP37288 418 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CASP2P42575 452 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FMO1Q01740 532 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NUCB1Q02818 461 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PPP2R5CQ13362 524 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 VEPH1Q14D04 833 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NAB2Q15742 525 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ITIH5Q86UX2 942 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TMC8Q8IU68 726 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NAXDQ8IW45 347 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PALM2Q8IXS6 379 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 C4orf19Q8IY42 314 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FRMD1Q8N878 549 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 APPL2Q8NEU8 664 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OR7D4Q8NG98 312 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CEP76Q8TAP6 659 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF480Q8WV37 535 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HMGB4Q8WW32 186 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KAT5Q92993 513 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CD101Q93033 1021 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TASP1Q9H6P5 420 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HPS4Q9NQG7 708 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CACNA1DQ01668 2161 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FAM149AA5PLN7 773 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 OVOL3O00110 214 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MUSKO15146 869 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM127O75204 238 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KNG1P01042 644 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINF2P08697 491 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CD59P13987 128 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TSHRP16473 764 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MALP21145 153 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ITPKBP27987 946 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CDC25CP30307 473 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC7A1P30825 629 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HSPA4P34932 840 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CHKAP35790 457 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ARL2P36404 184 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 DPP6P42658 865 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 IFNAR2P48551 515 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 PER3P56645 1201 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CFHR1Q03591 330 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TLE1Q04724 770 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FOXO1Q12778 655 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TTC22Q5TAA0 569 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RFX8Q6ZV50 586 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 BEND5Q7L4P6 421 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RNF152Q8N8N0 203 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF527Q8NB42 609 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT11Q96G61 164 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FAM20AQ96MK3 541 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FNBP1Q96RU3 617 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms