RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAR1BP31321 381 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RDXP35241 583 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT17Q04695 432 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALCOCO2Q13137 446 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DRP2Q13474 957 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNASE1L3Q13609 305 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAMK1Q14012 370 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTK2BQ14289 1009 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT3Q14435 633 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TERF2Q15554 542 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF394Q53GI3 561 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GFRALQ6UXV0 394 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 NECAB2Q7Z6G3 386 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFN1Q86VF2 1251 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM219Q86XT9 240 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSCBQ8IWL3 235 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ODF3L1Q8IXM7 274 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AADATQ8N5Z0 425 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPP10Q8N608 796 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 HORMAD2Q8N7B1 307 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP76Q8TAP6 659 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNG4Q8TDN1 519 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC15Q8TF66 581 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB12Q8WXK4 309 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 APPBP2Q92624 585 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB24Q969Q5 203 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDCA5Q96FF9 252 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACAP3Q96P50 834 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSF3RQ99062 836 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT12Q99456 494 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHRS4Q9BTZ2 278 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA9Q9BWV2 254 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTMR12Q9C0I1 747 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMX1Q9H3N1 280 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERAP1Q9NZ08 941 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA10Q9UK55 444 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACAD8Q9UKU7 415 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF510Q9Y2H8 683 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSAT1Q9Y617 370 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFNGQ9Y644 331 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPN7Q9Y6W3 813 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PN81 502 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXorf65A6NEN9 183 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB14A6NK59 587 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC85CA6NKD9 419 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHISA9B4DS77 424 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSI1O43347 362 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF861PO60384 105 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRCH4O75427 683 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJB3O75712 270 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSHBP01222 138 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAF1P04049 648 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSG2P11465 335 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTHFD2P13995 350 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CELP19835 753 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENPP1P22413 925 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFALSP35858 605 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRNA7P36544 502 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3CGP48736 1102 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPM6AP51674 278 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA3BQ13214 749 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC119Q13432 240 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF9Q16594 264 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q1RN00 199 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRFAM7AQ494W8 412 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTDC1Q4AE62 458 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMOTQ4VCS5 1084 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 AAGABQ6PD74 315 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFSD6Q6ZSS7 791 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF180Q86T96 592 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF280BQ86YH2 543 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYOCDQ8IZQ8 938 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT14Q8NB59 555 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TADA1Q96BN2 335 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERLEC1Q96DZ1 483 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARSGQ96EG1 525 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC45A3Q96JT2 553 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAC1Q96KF2 57 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNIP3Q96KP6 325 aa-0.93□□□□□ -2.56
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