RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NFATC4Q14934 902 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 WSCD2Q2TBF2 565 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 MYLK3Q32MK0 819 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN20Q4JDL3 420 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 GDPD4Q6W3E5 623 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PMEPA1Q969W9 287 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ZYG11BQ9C0D3 744 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 B3GNT4Q9C0J1 378 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 RDH14Q9HBH5 336 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 RRN3Q9NYV6 651 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 DACH1Q9UI36 760 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PLAAQ9Y263 795 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 POP4O95707 220 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 GSRP00390 522 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TNFP01375 233 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TIMP2P16035 220 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 USP8P40818 1118 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ATP1A2P50993 1020 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALNT1Q00973 533 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC14Q15048 493 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 EFHC2Q5JST6 749 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 FAM46DQ8NEK8 389 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 NT5C3BQ969T7 300 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PDXPQ96GD0 296 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 GSDMAQ96QA5 445 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 KLQ9UEF7 1012 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGC3Q9UN70 934 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 OR1A2Q9Y585 309 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 B4GAT1O43505 415 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CD44P16070 742 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 HTR1BP28222 390 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF7Q14155 803 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 INPP5AQ14642 412 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 MAP9Q49MG5 647 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM59Q8IWR1 403 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 IL22RA1Q8N6P7 574 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 NBASA2RRP1 2371 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 F9P00740 461 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A3P35503 534 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM52BQ4KMG9 183 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ISM2Q6H9L7 571 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TAF8Q7Z7C8 310 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PIM3Q86V86 326 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 OR1E3Q8WZA6 343 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SNX21Q969T3 373 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 WDR92Q96MX6 357 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TAAR9Q96RI9 348 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 HAPLN3Q96S86 360 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CDH19Q9H159 772 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD36A6QL64 1941 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 B4DGG1 531 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 AMZ1Q400G9 498 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 TTI2Q6NXR4 508 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 NETO2Q8NC67 525 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 MIB2Q96AX9 1013 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC34Q96HJ3 373 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 SYNCQ9H7C4 482 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 PLCB1Q9NQ66 1216 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 DGKBQ9Y6T7 804 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM202A6NGA9 273 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA7O14818 248 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 NKX2-8O15522 239 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE6O95741 557 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 PCCBP05166 539 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 OR1D5P58170 312 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 APBA1Q02410 837 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A52Q3SY17 297 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms