RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 DLC1Q96QB1 1528 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CEP152O94986 1710 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C9JVG2 144 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C2P06681 752 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 IRF1P10914 325 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CLCN2P51788 898 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 HSF2Q03933 536 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CTBP1Q13363 440 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 KLQ9UEF7 1012 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 E9PCH4 1651 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ADGRB3O60242 1522 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 CLTBP09497 229 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ACADVLP49748 655 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 DLG2Q15700 870 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 MED28Q9H204 178 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ENDOD1O94919 500 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 IDO1P14902 403 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 OR2T12Q8NG77 320 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 H3BMM5 538 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CLCN3P51790 818 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 LSAMPQ13449 338 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 MARC1Q5VT66 337 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MIB1Q86YT6 1006 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 JCADQ9P266 1359 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 H0YGN5 161 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MAGEB3O15480 346 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 LRIG2O94898 1065 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C9P02748 559 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 COX7A2P14406 83 aa9.84□□□□□ -0.83
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