RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 GSDMDP57764 484 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 NXPH1P58417 271 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DYNLT1P63172 113 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SKOR1P84550 965 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 WASHC5Q12768 1159 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KIF5AQ12840 1032 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PPP2R5EQ16537 467 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CDKN3Q16667 212 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 UGP2Q16851 508 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HLA-BQ31612 363 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MARC1Q5VT66 337 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KAZNQ674X7 775 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KCTD16Q68DU8 428 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 NEK5Q6P3R8 708 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 LIPIQ6XZB0 460 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF662Q6ZS27 426 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 BBS12Q6ZW61 710 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PIP4P1Q86T03 277 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DAAM2Q86T65 1068 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA1328Q86T90 577 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TTC7BQ86TV6 843 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HORMAD1Q86X24 394 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RFX6Q8HWS3 928 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RCOR2Q8IZ40 523 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 EXD1Q8NHP7 514 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CEP76Q8TAP6 659 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 NETO1Q8TDF5 533 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PIH1D2Q8WWB5 315 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SPOCK2Q92563 424 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CENPTQ96BT3 561 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HAUS1Q96CS2 278 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 HES6Q96HZ4 224 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SERAC1Q96JX3 654 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC114Q96M63 670 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 IL12RB2Q99665 862 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MYOCQ99972 504 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SEMA3CQ99985 751 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 EDEM2Q9BV94 578 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KDM4CQ9H3R0 1056 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 USP29Q9HBJ7 922 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PREBQ9HCU5 417 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 NT5MQ9NPB1 228 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GPR27Q9NS67 375 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DONSONQ9NYP3 566 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KLF15Q9UIH9 416 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 COQ6Q9Y2Z9 468 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms