RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NLRP4Q96MN2 994 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP7D2Q96T17 732 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 YME1L1Q96TA2 773 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDT1Q9H211 546 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FSD2A1L4K1 749 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC53A6NM62 1247 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRSS47A8MTI9 375 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 A8MZ25 164 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLRF2D3W0D1 207 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L23D6RBM5 183 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPEF2O14830 753 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LDB2O43679 373 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIASO43766 372 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTP4A3O75365 173 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MOSPD3O75425 235 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYF6P23409 242 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARL3P36405 182 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABCG1P45844 678 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ME1P48163 572 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZP1P60852 638 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ST3GAL1Q11201 340 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-190P-201ENST00000384154 LAMB3Q13751 1172 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LPIN1Q14693 890 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTGR1Q14914 329 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SHBQ15464 509 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEA1Q16626 185 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TCTN1Q2MV58 587 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPATA1Q5VX52 437 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-190P-201ENST00000384154 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-190P-201ENST00000384154 GTF3C6Q969F1 213 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXL8Q96CD0 374 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 APOLD1Q96LR9 279 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-190P-201ENST00000384154 PSAT1Q9Y617 370 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KAT6AQ92794 2004 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 H0YGN5 161 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNAP23O00161 211 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP2C2O75185 946 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOX30O94993 753 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPARCP09486 303 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PSG1P11464 419 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXB2P14652 356 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARSBP15848 533 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 AGAP20933 346 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 BDNFP23560 247 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLCD1P51178 756 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLCN5P51795 746 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 P2RX3P56373 397 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRIK3Q13003 919 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRKG2Q13237 762 aa3.24□□□□□ -1.89
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