RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 GNALP38405 381 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 DLG1Q12959 904 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 HADHQ16836 314 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TIGD6Q17RP2 521 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 RAPH1Q70E73 1250 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 LEMD2Q8NC56 503 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TNKS2Q9H2K2 1166 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 AOC2O75106 756 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CLCN3P51790 818 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NOMO3P69849 1222 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NOMO1Q15155 1222 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ZNF284Q2VY69 593 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MACC1Q6ZN28 852 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CLYBLQ8N0X4 340 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TTLQ8NG68 377 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 C7orf26Q96N11 449 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TTPALQ9BTX7 342 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PXMP2Q9NR77 195 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 H3BM21 787 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 HSPA12AO43301 675 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 DFNA5O60443 496 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 GLAP06280 429 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ERVK-21P61565 698 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 HTRA3P83110 453 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ABRQ12979 859 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 OR5J2Q8NH18 312 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MCFD2Q8NI22 146 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 DEFB118Q96PH6 123 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 WDR18Q9BV38 432 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 USP29Q9HBJ7 922 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 FAM50BQ9Y247 325 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PJA2O43164 708 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PNPP00491 289 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 SRP54P61011 504 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ACVR2BQ13705 512 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 INPP5AQ14642 412 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 KDELC1Q6UW63 502 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 FAM47BQ8NA70 645 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 RORBQ92753 470 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 GPAMQ9HCL2 828 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.8□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 A8MUA0 341 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 KCNK1O00180 336 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MSH4O15457 936 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TGDSO95455 350 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 EYA4O95677 639 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NCAM1P13591 858 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ALCAMQ13740 583 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 C6orf52Q5T4I8 152 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MPP5Q8N3R9 675 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 KIF12Q96FN5 646 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 SCN3BQ9NY72 215 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 MOCS1Q9NZB8 636 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 WWOXQ9NZC7 414 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 H7C1Q1 480 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PITPNM1O00562 1244 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 GSTA4O15217 222 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 FUCA1P04066 466 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TNFRSF8P28908 595 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 GCLMP48507 274 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 ENPEPQ07075 957 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 AMER2Q8N7J2 671 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 NXNL1Q96CM4 212 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 LACRTQ9GZZ8 138 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 TMEM39AQ9NV64 488 aa13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CTIF-202ENST00000382998 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms