RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQU0 124 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN11A1L157 253 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK1O00180 336 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF103O00237 685 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SYPP08247 313 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMP2P16035 220 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 CR2P20023 1033 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 TGM1P22735 817 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 MAXP61244 160 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SGCGQ13326 291 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC6Q16204 474 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 UGP2Q16851 508 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 VAT1Q99536 393 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 H7C0C1 242 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 AREL1O15033 823 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SDHBP21912 280 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5OP48047 213 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2CBP62714 309 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2CAP67775 309 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SPOCK2Q92563 424 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 VOPP1Q96AW1 172 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SERAC1Q96JX3 654 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.52■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 FRYLO94915 3013 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf142B7Z368 130 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 AKT2P31751 481 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ABL2P42684 1182 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIA4P48058 902 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 IRX4P78413 519 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY2Q08462 1091 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NOMO1Q15155 1222 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF284Q2VY69 593 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX44Q53QW1 395 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTL9Q8TC94 416 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB12Q8WXK4 309 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.076e-6■■■■□ 23.1
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PGGT1B-202ENST00000379615 SMOC1Q9H4F8 434 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CAPN10Q9HC96 672 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PATE3B3GLJ2 98 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC31A1O15431 190 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEC1O60732 1142 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DQB2P05538 268 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 C21orf59P57076 290 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM193AP78312 1265 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 DSC2Q02487 901 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 OVGP1Q12889 678 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB17Q13105 803 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 STAT4Q14765 748 aa15.5■□□□□ 0.07
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