RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKAR2BP31323 418 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPC5P78333 572 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKAA1Q13131 559 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTK7Q13308 1070 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ELMO3Q96BJ8 720 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GIMAP5Q96F15 307 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0A6YYH2 397 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR14I1A6ND48 311 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 A6NJ64 397 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC26A5P58743 744 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEI1Q5TIA1 1274 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLHL35Q6PF15 583 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARSKQ6UWY0 536 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYS1Q717R9 158 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LINC00471Q8N535 108 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GLTPQ9NZD2 209 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNH4Q9UQ05 1017 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A087X0B3 334 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPM1DO15297 605 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM13AO94988 1023 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 AXLP30530 894 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SERPINF1P36955 418 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTPRKQ15262 1439 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCTE1Q5JU00 501 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR158Q5T848 1215 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DPH6Q7L8W6 267 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 E2F7Q96AV8 911 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIK3C2AO00443 1686 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0G2JND7 137 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF233A6NK53 670 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLOCKO15516 846 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PLIN3O60664 434 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRIG2O94898 1065 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GYPCP04921 128 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CD72P21854 359 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PFKPQ01813 784 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 EHHADHQ08426 723 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCNG2Q16589 344 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CDAN1Q8IWY9 1227 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LGI2Q8N0V4 545 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NXNL1Q96CM4 212 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF145Q96MT1 663 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZFP57Q9NU63 452 aa3.46□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FANCGO15287 622 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 CES1P23141 567 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 SDC2P34741 201 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 DDOSTP39656 456 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB8AP61006 207 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 GNA12Q03113 381 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC3A1Q07837 685 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 FADDQ13158 208 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 RHEBQ15382 184 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRAM1Q15629 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 SSX2Q16385 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 EID3Q8N140 333 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 MIER2Q8N344 545 aa3.46□□□□□ -1.86
PKHD1L1-201ENST00000378402 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms