RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376395.8

UBQLN1-202, Transcript of ubiquilin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN1, Length 4,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN1-202ENST00000376395 OXSMQ9NWU1 459 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 A0A087WXM4 84 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 TREHO43280 583 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 RENBPP51606 427 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 RAD51Q06609 339 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 BFSP2Q13515 415 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 ARSAP15289 507 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 CEACAM7Q14002 265 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 PCED1BQ96HM7 432 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 MUC3BQ9H195 1237 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 C1orf21Q9H246 121 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 EMCNQ9ULC0 261 aa14.9□□□□□ -0.02
UBQLN1-202ENST00000376395 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SLC12A8A0AV02 714 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ADCY6O43306 1168 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PCYT1AP49585 367 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 RIN3Q8TB24 985 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 IPPQ9Y573 584 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MGEA5O60502 916 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SLC1A2P43004 574 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MTTPP55157 894 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MICU2Q8IYU8 434 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MYLPFQ96A32 169 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 A0A0J9YYE9 177 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MS4A2Q01362 244 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 GBA3Q9H227 469 aa14.89□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 DHRS12A0PJE2 317 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 A8MX80 341 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 BTN3A1O00481 513 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 GALNT3Q14435 633 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ANKS6Q68DC2 871 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 FBXO30Q8TB52 745 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CEP19Q96LK0 163 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 ACOX2Q99424 681 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 GLOD4Q9HC38 313 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 HMX2A2RU54 273 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PAGE1O75459 146 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PFKMP08237 780 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SLC2A3P11169 496 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 BTBD9Q96Q07 612 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SORT1Q99523 831 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 VWA7Q9Y334 891 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 128.6
UBQLN1-202ENST00000376395 PRKCGP05129 697 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 XIAPP98170 497 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MFSD10Q14728 455 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 MAPK11Q15759 364 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 TLK2Q86UE8 772 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 FBXO32Q969P5 355 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 C12orf42Q96LP6 360 aa14.88□□□□□ -0.03
UBQLN1-202ENST00000376395 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms