RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CCNCP24863 283 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB2P25686 324 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CD151P48509 253 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PRKAA2P54646 552 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RAB10P61026 200 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SEPT6Q14141 434 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TICAM1Q8IUC6 712 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CEP97Q8IW35 865 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RCN3Q96D15 328 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GLOD4Q9HC38 313 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ARL5CA6NH57 179 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF24P17028 368 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 NUMBP49757 651 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC12A2P55011 1212 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ART3Q13508 389 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CCL14Q16627 93 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CROCCP3Q8IVE0 287 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ABHD8Q96I13 439 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TSGA13Q96PP4 275 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CCT7Q99832 543 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN18Q99952 460 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CORO1BQ9BR76 489 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 STK39Q9UEW8 545 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PGK1P00558 417 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 HK2P52789 917 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PKNOX1P55347 436 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PFKPQ01813 784 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MAP2K5Q13163 448 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD21Q4G0X4 260 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 METTL23Q86XA0 190 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 LSMEM2Q8N112 164 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RNF148Q8N7C7 305 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN14Q8NG11 270 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 HASPINQ8TF76 798 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CNDP1Q96KN2 507 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB7O75635 380 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ODC1P11926 461 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 IDO1P14902 403 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC1A2P43004 574 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 THOP1P52888 689 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GEMP55040 296 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CREB5Q02930 508 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FLOT2Q14254 428 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TRIML2Q8N7C3 387 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DPF3Q92784 378 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FCRL5Q96RD9 977 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.29□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM233B4DJY2 109 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 B3GAT3O94766 335 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF23P17027 643 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 HOXD12P35452 270 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 BRCC3P46736 316 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CSRP3P50461 194 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RELAQ04206 551 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PCSK7Q16549 785 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RNF135Q8IUD6 432 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 BIRC8Q96P09 236 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PKP2Q99959 881 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CHST12Q9NRB3 414 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms