RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373337.3

TMEM35B-201, Transcript of transmembrane protein 35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM35B, Length 922 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35B-201ENST00000373337 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 AGERQ15109 404 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 IQCDQ96DY2 449 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.16■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 NEMP2A6NFY4 417 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 FFAR2O15552 330 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 MMP20O60882 483 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 JUPP14923 745 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 TCF4P15884 667 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 YPEL5P62699 121 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 IL10RBQ08334 325 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 CYP4F3Q08477 520 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 UGP2Q16851 508 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 APOLD1Q96LR9 279 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 TBATAQ96M53 351 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 USP29Q9HBJ7 922 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 RP1P56715 2156 aa20.15■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 CACNA1GO43497 2377 aa20.14■□□□□ 0.82
TMEM35B-201ENST00000373337 H3BM21 787 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 K7ESM1 405 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 ALPPL2P10696 532 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 MMP12P39900 470 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 UBASH3AP57075 661 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 ZBED6P86452 979 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 LZTR1Q8N653 840 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 SPOCK2Q92563 424 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NXPE2Q96DL1 559 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NENFQ9UMX5 172 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 RAXQ9Y2V3 346 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 DAPK3O43293 454 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NEBLO76041 1014 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 GYPCP04921 128 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 SERPING1P05155 500 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 GP1BAP07359 652 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TPM4P67936 248 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 DAB2P98082 770 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 E2F1Q01094 437 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 RTP5Q14D33 572 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 BOLA3Q53S33 107 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 HS1BP3Q53T59 392 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 MACC1Q6ZN28 852 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 SRLQ86TD4 932 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 VPS36Q86VN1 386 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PSKH2Q96QS6 385 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 THAP2Q9H0W7 228 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 ZWILCHQ9H900 591 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 A0A087X0T9 212 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 CFAP69A5D8W1 941 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 TPP1O14773 563 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 MUSKO15146 869 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 AQP9O43315 295 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PALMO75781 387 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PEX11BO96011 259 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 CYP1A2P05177 515 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 FAM228BP0C875 321 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 C6P13671 934 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 JUNDP17535 347 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PTK2BQ14289 1009 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 IRF4Q15306 451 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM35B-201ENST00000373337 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms