RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ASAP2O43150 1006 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS11O94810 467 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TFP02787 698 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ALPLP05186 524 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGAXP20702 1163 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 DDIT3P35638 169 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CPOXP36551 454 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN7P41732 249 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT6P53370 316 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HDAC4P56524 1084 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP10-11P60412 298 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ST3GAL1Q11201 340 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIK3Q13003 919 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF6Q15052 776 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2R5BQ15173 497 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NOXA1Q86UR1 476 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX19Q8NA77 164 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 BBS4Q96RK4 519 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 BRF2Q9HAW0 419 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CYSLTR2Q9NS75 346 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO6Q9UM54 1294 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GVM2 712 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 INSIG1O15503 277 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TGFB1I1O43294 461 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MBD4O95243 580 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TBX18O95935 607 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXC6P09630 235 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF1P10914 325 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CD53P19397 219 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFAIP3P21580 790 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MLH1P40692 756 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ4P48050 445 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 GNAQP50148 359 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CCR9P51686 369 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SHBQ15464 509 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SGO1Q5FBB7 561 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRPQ86YL5 185 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTROBQ8N137 903 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CADM4Q8NFZ8 388 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL6Q8TCB7 284 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIB2Q92519 343 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 OTULINQ96BN8 352 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 C7orf26Q96N11 449 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCL3Q9H2J4 239 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM51Q9NW97 253 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SCINQ9Y6U3 715 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 J3KR12 359 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM23O14925 209 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC14L5O43304 696 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MTA2O94776 668 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM63AO94886 807 aa3.99□□□□□ -1.77
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RABGGTB-202ENST00000370826 ETFAP13804 333 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 AGAP20933 346 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ICAM3P32942 547 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SHMT1P34896 483 aa3.99□□□□□ -1.77
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RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 GABRB2P47870 512 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 AMTP48728 403 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 PCYT1AP49585 367 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 HTR6P50406 440 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP10-9P60411 292 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGADQ13349 1161 aa3.99□□□□□ -1.77
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