RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 DRD4P21917 467 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP1P78357 1384 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FFAR3O14843 346 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GPR42O15529 346 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA6P08185 405 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CENPXA8MT69 81 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 AZIN1O14977 448 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PAGE1O75459 146 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TNS4Q8IZW8 715 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 IQCKQ8N0W5 287 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TTKP33981 857 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD7P51665 324 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A5Q14940 896 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RBFAQ8N0V3 343 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RIPK3Q9Y572 518 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT14O95848 222 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 OR1D2P34982 312 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNB1P35222 781 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TEX44Q53QW1 395 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HGSNATQ68CP4 663 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DET1Q7L5Y6 550 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CD101Q93033 1021 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TTPALQ9BTX7 342 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC28A1O00337 649 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM38O00635 465 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AVILO75366 819 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CASZ1Q86V15 1759 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FLT3LGP49771 235 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAG1P54619 331 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MARK4Q96L34 752 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN11O75508 207 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TNK2Q07912 1038 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NRF1Q16656 503 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf60Q96EN9 201 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PIPSLA2A3N6 862 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 STX11O75558 287 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MMP3P08254 477 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FLT3P36888 993 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 STX4Q12846 297 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CHADLQ6NUI6 762 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GPR180Q86V85 440 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SH3GL2Q99962 352 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf18Q9UK00 162 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 UMPSP11172 480 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA3P29320 983 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 IL1BP01584 269 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BNIP2Q12982 314 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TRIQKQ629K1 86 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms