RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 YME1L1Q96TA2 773 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIP5K1AQ99755 562 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SYNCQ9H7C4 482 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 POT1Q9NUX5 634 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 IL36RNQ9UBH0 155 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 COG5Q9UP83 839 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAI2Q9Y5P3 530 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 A0A1W2PPC1 479 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FSD2A1L4K1 749 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLRF2D3W0D1 207 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MS4A18H0YCH9 400 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 WNT9BO14905 357 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCAMP1O15126 338 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TGFB1I1O43294 461 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEC14L5O43304 696 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTP4A3O75365 173 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TSPAN9O75954 239 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDUFB4O95168 129 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLDN7O95471 211 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SYF2O95926 243 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MMP2P08253 660 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFPIP10646 304 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BDNFP23560 247 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NFKBIAP25963 317 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ICAM3P32942 547 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MLH1P40692 756 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RGS2P41220 211 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ABCG1P45844 678 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EFNA5P52803 228 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HDAC4P56524 1084 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SELENOVP59797 346 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ITGADQ13349 1161 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CRYMQ14894 314 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTGR1Q14914 329 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP41Q3LFD5 358 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 C11orf87Q6NUJ2 197 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CFAP161Q6P656 301 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LINGO2Q7L985 606 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIM3Q86V86 326 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PALB2Q86YC2 1186 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPSM1Q86YR5 675 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDILTQ8N807 584 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FRMD1Q8N878 549 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ENGASEQ8NFI3 743 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BEST2Q8NFU1 509 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCFD2Q8WU76 684 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM68Q96MH6 324 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HEMGNQ9BXL5 484 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ISCUQ9H1K1 167 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTMR6Q9Y217 621 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIAS3Q9Y6X2 628 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HSPB2A8KAH6 182 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 VWA5AO00534 786 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLK8O60259 260 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FGF2P09038 288 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDK4P11802 303 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ETFAP13804 333 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 AGAP20933 346 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TM4SF1P30408 202 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PSMB10P40306 273 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms