RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RAB10P61026 200 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 IL17AQ16552 155 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PARGQ86W56 976 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 KREMEN2Q8NCW0 462 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C5orf60A6NFR6 353 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 H0Y858 1186 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TACR2P21452 398 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ME2P23368 584 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TALDO1P37837 337 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 WASP42768 502 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TLE2Q04725 743 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF398Q8TD17 642 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GPR88Q9GZN0 384 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC19Q9H756 370 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 VIPP01282 170 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C8AP07357 584 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CRATP43155 626 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RNFT2Q96EX2 444 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RNF145Q96MT1 663 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 A0A1B0GVM2 712 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ARL5CA6NH57 179 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GPR25O00155 361 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 DCXO43602 365 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 KCNH1O95259 989 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C16orf46Q6P387 395 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FLCNQ8NFG4 579 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 P2RY11Q96G91 374 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FUT2Q10981 343 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SNX32Q86XE0 403 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HERVK_113Q902F9 699 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CHKBQ9Y259 395 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ITGAXP20702 1163 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MMP8P22894 467 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CXCR3P49682 368 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GAD2Q05329 585 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C17orf64Q86WR6 236 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CREG2Q8IUH2 290 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ITFG1Q8TB96 612 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CD101Q93033 1021 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CENPTQ96BT3 561 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NEK6Q9HC98 313 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SLC28A1O00337 649 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PRMT3O60678 531 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PSMD8P48556 350 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GPR141Q7Z602 305 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SETD9Q8NE22 299 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MTERF3Q96E29 417 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NDNQ99608 321 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 APOL4Q9BPW4 351 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms