RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RAPH1Q70E73 1250 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 HERVK_113Q902F9 699 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 HDAC10Q969S8 669 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.02■□□□□ 0.48
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ACTB-201ENST00000331789 GSTA1P08263 222 aa18.02■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 HTR3DQ70Z44 454 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.02■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 KCNK13Q9HB14 408 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ASAH2Q9NR71 780 aa18.02■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 VPS28Q9UK41 221 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LZTS1Q9Y250 596 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 CD151P48509 253 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CLCN4P51793 760 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 OCRLQ01968 901 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CDH18Q13634 790 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CCDC153Q494R4 210 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CEP97Q8IW35 865 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 SMIM14Q96QK8 99 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.01■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.01■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JND7 137 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LEFTY2O00292 366 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RFPL2O75678 378 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 PRLP01236 227 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MAGEA9P43362 315 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ZNF460Q14592 562 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC14A2Q15849 920 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 APCDD1Q8J025 514 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MICALL1Q8N3F8 863 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GPATCH11Q8N954 259 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TCEAL4Q96EI5 215 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 TBATAQ96M53 351 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 C7orf26Q96N11 449 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NUDCD1Q96RS6 583 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 COPG2Q9UBF2 871 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LHX3Q9UBR4 397 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 VPS51Q9UID3 782 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SPO11Q9Y5K1 396 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A4O43246 635 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF15O94989 841 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 PDHA1P08559 390 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC35E2BP0CK96 405 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CPA3P15088 417 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DBN1Q16643 649 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 MFN1Q8IWA4 741 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 CALML6Q8TD86 181 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 BRSK1Q8TDC3 778 aa18■□□□□ 0.47
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