RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 GARSP41250 739 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RXRGP48443 463 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCNN1BP51168 640 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HADHBP55084 474 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBE1Q04446 702 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM52BQ4KMG9 183 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC38Q5VT99 294 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC49Q8IUZ0 686 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND6BQ8NEG7 585 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAP25Q8TEE9 199 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMFQ96LC9 184 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH12Q9NPG4 1184 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 POM121BA6NF01 834 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF487B1APH4 448 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT1P04264 644 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCGP05129 697 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMTP21964 271 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP12P39900 470 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC1A1P43005 524 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRK6P43250 576 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP13P45452 471 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L1Q07817 233 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELP6Q0PNE2 266 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXC1Q12948 553 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGCGQ13326 291 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP58Q5T655 872 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM7AQ6ZMT4 941 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLRX5Q86SX6 157 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf40AQ8TE69 158 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSMCE1Q8WV22 266 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF157Q96PX1 679 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDCD1Q96RS6 583 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASF3Q9UPY6 502 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM7SF2O76062 418 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA10O95299 355 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 FTH1P19P0C7X4 201 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAXP61244 160 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHC2P98077 582 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPA17Q15506 151 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 INAVAQ3KP66 663 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARC1Q5VT66 337 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZSR6 202 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSIG1Q86XK7 387 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS5Q8N3I7 341 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX26Q8N6G2 289 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLD5Q8N7P1 536 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAML1Q92585 1016 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOD2Q9HC29 1040 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTLQ9NZJ0 730 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 FPGTO14772 594 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPOPO43791 374 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGAVP06756 1048 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFALSP35858 605 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMG2Q02383 582 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALGDSQ12967 914 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNIP3Q12983 259 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9A4Q6AI14 798 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERAP2Q6P179 960 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMTC1Q8IUR5 882 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPOCK2Q92563 424 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 FATE1Q969F0 183 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPTQ96BT3 561 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSGA13Q96PP4 275 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC6Q99741 560 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAAP1Q9H8G2 361 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 NT5MQ9NPB1 228 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCUBE2Q9NQ36 999 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ6Q9Y2Z9 468 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms