RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 FOXO4P98177 505 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MTMR2Q13614 643 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RAD18Q9NS91 495 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PHF24Q9UPV7 400 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CLUHO75153 1309 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PDPK1O15530 556 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PEX11AO75192 247 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MAP3K6O95382 1288 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 KLRC3Q07444 240 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ERFEQ4G0M1 354 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SPATA33Q96N06 139 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 A0A087WZ62 844 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HACD1B0YJ81 288 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ALG9Q9H6U8 611 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HTR2BP41595 481 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ACTR3P61158 418 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CYP24A1Q07973 514 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MAMLD1Q13495 774 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ERAP2Q6P179 960 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 XKRXQ6PP77 449 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 BAP1Q92560 729 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TFEBP19484 476 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 BTBD16Q32M84 506 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TCEA3O75764 348 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF410Q86VK4 478 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CRELD1Q96HD1 420 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 GAD1Q99259 594 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 AURKAO14965 403 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 LINC00032P0C843 101 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FBXO43Q4G163 708 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 XKR5Q6UX68 686 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FOXN2P32314 431 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ALDH9A1P49189 494 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ALDH3A2P51648 485 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MYBPC3Q14896 1274 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 C7orf26Q96N11 449 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CDH15P55291 814 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 WDR48Q8TAF3 677 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 STX16O14662 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 OR5F1O95221 314 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FTH1P02794 183 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SPIBQ01892 262 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 VPS51Q9UID3 782 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 EPB42P16452 691 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TGM3Q08188 693 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TIGD4Q8IY51 512 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TREM1Q9NP99 234 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ANGPTL1O95841 491 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ITGB1P05556 798 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RB1P06400 928 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 GPIP06744 558 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HALP42357 657 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 IDH3AP50213 366 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms