RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 LRIG2O94898 1065 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 CLCN2P51788 898 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 GALNT2Q10471 571 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SEMA3BQ13214 749 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SQLEQ14534 574 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 PCID2Q5JVF3 399 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 WSCD1Q658N2 575 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ARMCX2Q7L311 632 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 BNIPLQ7Z465 357 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 FNDC8Q8TC99 324 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 LZICQ8WZA0 190 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 HDAC11Q96DB2 347 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TNIP3Q96KP6 325 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SMOXQ9NWM0 555 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 A8MT66 165 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 NCAM2O15394 837 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 IMPDH2P12268 514 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TAF6P49848 677 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MAPK10P53779 464 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 CDH13P55290 713 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 UGP2Q16851 508 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TBCELQ5QJ74 424 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 RETREG3Q86VR2 466 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TFAP2CQ92754 450 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 EXT2Q93063 718 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ISOC1Q96CN7 298 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 C3orf30Q96M34 536 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 OLFM1Q99784 485 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 MUC3BQ9H195 1237 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 WDCPQ9H6R7 721 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 DERAQ9Y315 318 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF3-202ENST00000299667 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 H0YJX3 145 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 NR5A2O00482 541 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 ATP6V1G1O75348 118 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 SUPT3HO75486 399 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 CPB1P15086 417 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 CHRM3P20309 590 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 CD151P48509 253 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 KCNC1P48547 511 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 PSMD8P48556 350 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 SLC5A3P53794 718 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 LILRA4P59901 499 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 ESRRGP62508 458 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 MAPRE2Q15555 327 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 MOB2Q70IA6 237 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 BBS5Q8N3I7 341 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF3-202ENST00000299667 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms