RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 BORCS5Q969J3 196 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CHST12Q9NRB3 414 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 KPNA6O60684 536 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TPH1P17752 444 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 COPAP53621 1224 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 LILRA2Q8N149 483 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 HGH1Q9BTY7 390 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 A8MU76 341 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CD1EP15812 388 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 UGT1A6P19224 532 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MX2P20592 715 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CD247P20963 164 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 UGT1A1P22309 533 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 UGT1A4P22310 534 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 UGT1A3P35503 534 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 UGT1A5P35504 534 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB17Q13105 803 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 EDEM1Q92611 657 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MYLPFQ96A32 169 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 LRGUKQ96M69 825 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 BFARQ9NZS9 450 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 DYTNA2CJ06 578 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NCAM2O15394 837 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PGK1P00558 417 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CTGFP29279 349 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 UPP1Q16831 310 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CLEC14AQ86T13 490 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 IFNL1Q8IU54 200 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ISOC1Q96CN7 298 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 HDAC11Q96DB2 347 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KLHL2O95198 593 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ATE1O95260 518 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ITGAXP20702 1163 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SAT1P21673 171 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CREB5Q02930 508 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SERINC5Q86VE9 423 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KLHL41O60662 606 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PCSK1P29120 753 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 HMOX2P30519 316 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MGAT3Q09327 533 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GALNT2Q10471 571 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SEPT6Q14141 434 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KCNJ8Q15842 424 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 DPF3Q92784 378 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 AQP9O43315 295 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NRF1Q16656 503 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GPR180Q86V85 440 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 THAP11Q96EK4 314 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 HAUS8Q9BT25 410 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 G3V2L1 256 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms