RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 UBOX5O94941 541 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 AVPR1AP37288 418 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CSRP3P50461 194 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PCLAFQ15004 111 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ATG16L1Q676U5 607 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 RAPH1Q70E73 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 HTR3DQ70Z44 454 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC14AQ86T13 490 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 GCNAQ96QF7 691 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 LAMA3Q16787 3333 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TMCC1O94876 653 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 HADHAP40939 763 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRCAPQ14761 206 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 DDI1Q8WTU0 396 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC10Q969S8 669 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TLR9Q9NR96 1032 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PLK2Q9NYY3 685 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01553A4QN01 128 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 NDST3O95803 873 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SCTRP47872 440 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MFN1Q8IWA4 741 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TNS4Q8IZW8 715 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ALG14Q96F25 216 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF15O94989 841 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 IL1BP01584 269 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 IRS1P35568 1242 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF460Q14592 562 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MBLAC2Q68D91 279 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CNSTQ6PJW8 725 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 COPG2Q9UBF2 871 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 OR51F1A6NGY5 319 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 LEFTY2O00292 366 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 GSTA1P08263 222 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CD151P48509 253 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 OCRLQ01968 901 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CEP97Q8IW35 865 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TBATAQ96M53 351 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 VPS51Q9UID3 782 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TGDSO95455 350 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PDHA1P08559 390 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MYOGP15173 224 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEP78395 509 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SLC14A2Q15849 920 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC153Q494R4 210 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 GALNTL6Q49A17 601 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 APCDD1Q8J025 514 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 GPATCH11Q8N954 259 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 C7orf26Q96N11 449 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM14Q96QK8 99 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 TLK1Q9UKI8 766 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CCL26Q9Y258 94 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JND7 137 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A4O43246 635 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PRLP01236 227 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 STX3Q13277 289 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CALML6Q8TD86 181 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 RMDN1Q96DB5 314 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.9■■□□□ 1.26
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