RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RUBCNLQ9H714 662 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNCQ9H7C4 482 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RMND1Q9NWS8 449 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTCH2Q04721 2471 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRK2Q5S007 2527 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 B4DGG1 531 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 B4E171 279 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 E5RJQ4 531 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 AGRPO00253 132 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 P4HA2O15460 535 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP20O60882 483 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GSRP00390 522 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B4P06133 528 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAR1AP10644 381 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT5P13647 590 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH4A1P30038 563 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN7P41732 249 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR3P46089 330 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD18Q0P651 414 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MTM1Q13496 603 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM3Q14832 879 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG11Q2TAA5 492 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM129CQ86XR2 697 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ART4Q93070 314 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf74Q96LT6 269 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB7Q99436 277 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 APOOQ9BUR5 198 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.95□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0D9SEW6 157 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF10CO14798 259 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 AREL1O15033 823 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PMM2O15305 246 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP12O43422 761 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF6O95976 241 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCGP05129 697 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL4P13236 92 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKBIAP25963 317 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 STAT1P42224 750 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ABL2P42684 1182 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SYKP43405 635 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FMO5P49326 533 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMK2P53671 638 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MLLT10P55197 1068 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GPLD1P80108 840 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GNA12Q03113 381 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC63Q05C16 580 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCLQ13371 301 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 STIM1Q13586 685 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF4Q15306 451 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf46Q6P387 395 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC34A3Q8N130 599 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ESX1Q8N693 406 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PAF1Q8N7H5 531 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR7Q8N806 425 aa7.94□□□□□ -1.14
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