RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296387.5

CLDN19-201, Transcript of claudin 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN19, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19-201ENST00000296387 TRIM8Q9BZR9 551 aa12.75□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 COL1A2P08123 1366 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 A8MT66 165 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CCL22O00626 93 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 TPST1O60507 370 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 GRIA3P42263 894 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SCAPQ12770 1279 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 BTBD8Q5XKL5 378 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 BORAQ6PGQ7 559 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CHSY3Q70JA7 882 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SH3RF2Q8TEC5 729 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 KCTD13Q8WZ19 329 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 OSBPL11Q9BXB4 747 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MYRFQ9Y2G1 1151 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 BTBD19C9JJ37 291 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 AKAP10O43572 662 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 GPC4O75487 556 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 COL6A2P12110 1019 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ATP6V1B2P21281 511 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SOX11P35716 441 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SLC12A2P55011 1212 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 STX5Q13190 355 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PCSK7Q16549 785 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 FIBCD1Q8N539 461 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SLC9A7Q96T83 725 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 HAUS8Q9BT25 410 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CD300AQ9UGN4 299 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.74□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 OTOFQ9HC10 1997 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MTSS1O43312 755 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CPB1P15086 417 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 LRPAP1P30533 357 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ALDH3B2P48448 385 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CD151P48509 253 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PRKCQQ04759 706 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CYHR1Q6ZMK1 362 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 ANKRD49Q8WVL7 239 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PCED1BQ96HM7 432 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 C3orf30Q96M34 536 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 EBF1Q9UH73 591 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 FBXO5Q9UKT4 447 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PADI4Q9UM07 663 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 AURKCQ9UQB9 309 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CLIC3O95833 236 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC166P0CW27 439 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 DARSP14868 501 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SMPD1P17405 629 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SLC7A1P30825 629 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CTBSQ01459 385 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 SQLEQ14534 574 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 LPIN1Q14693 890 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 UGP2Q16851 508 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 TECRLQ5HYJ1 363 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 LINC00523Q86TU6 105 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 RETREG3Q86VR2 466 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CNTN4Q8IWV2 1026 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MROH8Q9H579 483 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MEAF6Q9HAF1 191 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 EGFL7Q9UHF1 273 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CROTQ9UKG9 612 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12.73□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 NRP2O60462 931 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 MMP3P08254 477 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 PNPLA4P41247 253 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 KCNC1P48547 511 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 HCAR3P49019 387 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 UBXN11Q5T124 520 aa12.72□□□□□ -0.37
CLDN19-201ENST00000296387 KLHL35Q6PF15 583 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms