RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 ME2P23368 584 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MAPK9P45984 424 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 NRLP54845 237 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CREMQ03060 361 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CBFBQ13951 182 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SPACA7Q96KW9 195 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 HAPLN2Q9GZV7 340 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 STBD1O95210 358 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 VAPBO95292 243 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MED26O95402 600 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RHOCP08134 193 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CYP2C18P33260 490 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SCNN1AP37088 669 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RAD23AP54725 363 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RHOAP61586 193 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM110Q86TL2 294 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 TTC7BQ86TV6 843 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CATSPER2Q96P56 530 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RAP2CQ9Y3L5 183 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SLC12A8A0AV02 714 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 POMCP01189 267 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CA9Q16790 459 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ACSBG2Q5FVE4 666 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RFWD3Q6PCD5 774 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RIN3Q8TB24 985 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CDCA5Q96FF9 252 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SENP8Q96LD8 212 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CDRT15Q96T59 188 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 EXO5Q9H790 373 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 NEK6Q9HC98 313 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PNPOQ9NVS9 261 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL3Q9UH77 587 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC189A1A4V9 331 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 AHCYL1O43865 530 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MFSD11O43934 449 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PDE9AO76083 593 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PRKCHP24723 683 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 RFX3P48380 749 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 NAGLUP54802 743 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 XIAPP98170 497 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 INCA1Q0VD86 236 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PEX6Q13608 980 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MFSD10Q14728 455 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 PCID2Q5JVF3 399 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 WSCD1Q658N2 575 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 SLC22A9Q8IVM8 553 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 OR6Y1Q8NGX8 325 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 CD274Q9NZQ7 290 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRG-201ENST00000295874 NFKBIEO00221 500 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 SUPT7LO94864 414 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 METTL18O95568 372 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 IFNA14P01570 189 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 IL6P05231 212 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 NFKB1P19838 968 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 PTPN3P26045 913 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 GPC1P35052 558 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 CDK18Q07002 472 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 TRIQKQ629K1 86 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 SLC9A4Q6AI14 798 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 VN1R5Q7Z5H4 357 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF614Q8N883 585 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 DLG3Q92796 817 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 TBL1YQ9BQ87 522 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO44Q9H4M3 255 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 DTLQ9NZJ0 730 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 RGSL1A5PLK6 1076 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 FAM159BA6NKW6 160 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 TLL1O43897 1013 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 CLPTM1O96005 669 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRG-201ENST00000295874 L1CAMP32004 1257 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms